Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Krtap1-4Q3V2D6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms