Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms