Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms