Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SvipQ3UZP4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms