Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm5460Q3UQ97 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm5460Q3UQ97 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm5460Q3UQ97 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5460Q3UQ97 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5460Q3UQ97 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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