Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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