Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms