Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms