Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms