Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms