Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U595 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U595 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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