Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hvcn1Q3U2S8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hvcn1Q3U2S8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hvcn1Q3U2S8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hvcn1Q3U2S8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hvcn1Q3U2S8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hvcn1Q3U2S8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms