Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms