Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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1700066B19RikQ3TS39 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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1700066B19RikQ3TS39 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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1700066B19RikQ3TS39 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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1700066B19RikQ3TS39 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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1700066B19RikQ3TS39 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700066B19RikQ3TS39 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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1700066B19RikQ3TS39 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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