Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms