Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc10Q3TLI0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms