Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms