Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms