Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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