Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms