Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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