Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gli2Q0VGT2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gli2Q0VGT2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gli2Q0VGT2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gli2Q0VGT2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gli2Q0VGT2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms