Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms