Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms