Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms