Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms