Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms