Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms