Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms