Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp2Q06649 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms