Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms