Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sox13Q04891 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sox13Q04891 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Sox13Q04891 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sox13Q04891 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sox13Q04891 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sox13Q04891 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sox13Q04891 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sox13Q04891 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sox13Q04891 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox13Q04891 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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