Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms