Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RelaQ04207 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms