Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms