Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crisp3Q03402 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms