Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms