Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms