Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms