Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms