Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms