Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms