Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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