Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cux2P70298 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux2P70298 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms