Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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