Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf5P70191 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf5P70191 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms