Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms