Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk2bP67871 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk2bP67871 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk2bP67871 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk2bP67871 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms