Protein–RNA interactions for Protein: P63005

Pafah1b1, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b1P63005 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b1P63005 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b1P63005 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms