Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ElobP62869 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ElobP62869 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ElobP62869 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ElobP62869 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ElobP62869 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ElobP62869 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ElobP62869 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ElobP62869 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms